โรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้รับการประกาศจัดตั้งจากกระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ 25 มีนาคม พุทธศักราช 2475 โดยกำเนิดขึ้น จากความต้องการให้มีโรงเรียนสำหรับเด็กผู้หญิงโดยเฉพาะในจังหวัดนนทบุรี เมื่อเริ่มก่อตั้งใช้ชื่อว่า “โรงเรียนสตรีประจำจังหวัดนนทบุรี” ใช้อักษรย่อว่า “น.บ. 2” ตั้งอยู่ศาลากลางจังหวัดนนทบุรีหลังเก่าริมแม่น้ำเจ้าพระยา วันที่ 29 มีนาคม 2475 ได้มีพิธีเปิดโรงเรียน โดยมี นางลัดดาวัลย์ นนทะนาคร เป็นครูใหญ่ มีครู 3 คน ห้องเรียน 4 ห้อง นักเรียน 33 คน วันที่ 10 กันยายน 2476 ได้ย้ายสถานที่มาอยู่ ณ หอประชุมใหญ่ ซึ่งปัจจุบันเป็นที่ตั้งของโรงเรียนอนุบาลนนทบุรี ในปีพุทธศักราช 2498 สมัยจอมพล ป.พิบูลสงคราม (แปลก พิบูลสงคราม) เป็นนายกรัฐมนตรีท่านเป็นชาวจังหวัดนนทบุรีโดยกำเนิด ได้ให้การช่วยเหลือโดยจัดหาที่ดิน และย้ายโรงเรียนสตรีนนทบุรี จากสถานที่เดิมซึ่งคับแคบมาอยู่ ณ ที่ปัจจุบัน เลขที่ 120 ถนนพิบูลสงคราม ตำบลสวนใหญ่ อำเภอเมือ จังหวัดนนทบุรี ตั้งแต่วันที่ 20 กันยายน พุทธศักราช 2498 ในเนื้อที่ 18 ไร่ 447 ตารางวา ในจำนวนนี้เป็นที่ดินซึ่งได้รับมอบจากวัดพลับพลา 2 ไร่ 44 ตารางวา และวัดปากน้ำ 1 ไร่ 1 งาน ในช่วงแรกจึงได้ชื่อว่า “โรงเรียนสตรีวัดพลับพลา” อักษรย่อว่า "น.บ. 2" วันที่ 16 พฤศจิกายน 2507 นางบรรจง นิวาศบุตร ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน ได้พัฒนาด้านการศึกษา สร้างอาคารสถานที่ และปรับปรุงสิ่งแวดล้อม โรงเรียนได้รับการพัฒนาเป็นอย่างมากในสมัยนี้ นอกจากนี้ยังได้เปลี่ยนชื่อจาก “โรงเรียนสตรีวัดพลับพลา” เป็น “โรงเรียนสตรีนนทบุรี” และขอให้อักษรย่อจาก น.บ. 2 เป็น น.บ. ทั้งนี้ ได้รับความเห็นชอบจากจังหวัดนนทบุรี โดยที่โรงเรียนสตรีนนทบุรีเป็นโรงเรียนสตรีแห่งแรกและแห่งเดียวในจังหวัดนนทบุรี วันที่ 8 กรกฎาคม 2523 นางสาวบำเพ็ญ ภู่โสภา ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ในปี 2525 โรงเรียนสตรีนนทบุรีได้รับคัดเลือกจากกระทรวงศึกษาธิการ ให้เป็นโรงเรียนดีเด่นรับรางวัลพระราชทานโรงเรียนมัธยมศึกษา ประจำปี 2525 นางสาวบำเพ็ญ ภู่โสภา ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรีเป็นเวลา 6 ปี วันที่ 14 พฤศจิกายน 2532 นางวณิช เฟื่องทอง ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ทำให้โรงเรียนมีชื่อเสียงในด้านการจัดการเรียนการสอนภาษาอังกฤษ เป็นศูนย์ฝึกอบรมครูผู้สอนวิชาภาษาอังกฤษของเขตการศึกษา 1 และมีชื่อเสียงดีเด่นในด้านการกีฬา ได้รับรางวัลชนะเลิศทั้งกีฬาวอลเลย์บอล บาสเกตบอล นอกจากนี้ยังได้รับการปรับปรุงอาคารสถานที่ โดยได้เชื่อมต่ออาคารทั้ง 3 อาคาร ทำให้ทั้งครูและนักเรียนได้รับความสะดวกเป็นอย่างมาก วันที่ 2 พฤศจิกายน 2532 นางสาวคนึง ไทยประสิทธิ์ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้กำหนดให้ "ดอกแก้ว" เป็นดอกไม้ประจำโรงเรียน กำหนดให้วันที่ 9 มกราคม เป็นวันรักโรงเรียน และได้พัฒนาโรงเรียนในทุกด้านจนเป็นที่ยอมรับของบุคคลทั่วไป มีโรงเรียนต่างๆ มาดูงานกันเป็นจำนวนมาก นางสาวคนึง ไทยประสิทธิ์ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี เป็นเวลา 6 ปี วันที่ 18 กันยายน 2538 นางสาวประไพศรี วิสัยจร ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้ปรับปรุงบริเวณโรงเรียน อาคารสถานที่ และสิ่งอำนวยความสะดวกด้านต่างๆ และในปี 2541 โรงเรียนสตรีนนทบุรีได้รับคัดเลือกจากกระทรวงศึกษาธิการ ให้เป็นโรงเรียนดีเด่นรับรางวัลพระราชทานโรงเรียนมัธยมศึกาประจำปี 2541 และนักเรียนได้รับคัดเลือกเป็นนักเรียนรับรางวัลพระราชทานปีการศึกษา 2542 รวมระยะเวลาในการดำรงตำแหน่ง 7 ปี วันที่ 14 พฤศจิกายน 2544 นายปิ่น สุวรรณะ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้แถลงนโยบายและเจตนารมณ์ในการพัฒนาและยกระดับ คุณภาพการเรียนการสอนให้สอดคล้องกับยุคสมัย และการปฏิรูปการศึกษาของกระทรวงศึกษาธิการ วันที่ 18 ธันวาคม 2544 นายพร รุจนเวช ผู้อำนวยการสามัญศึกษาจังหวัดนนทบุรี รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้พัฒนาคุณภาพการเรียนการสอน ตามนโยบายปฏิรูปการศึกษา พร้อมทั้งเตรียมความพร้อมโรงเรียนและครู อาจารย ์ในการใช้หลักสูตรการศึกาขั้นพื้นฐานพุทธศักราช 2544 วันที่ 4 มิถุนายน 2545 นางวิไลพร ศุภวณิช ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี โดยมีความมุ่งมั่นที่จะสืบสานเจตนารมณ์นโยบายและแนวทางการพัฒนาโรงเรียน ต่อจากอดีตผู้บริหารทุกท่านและมุ่งเน้นพัฒนาโรงเรียนให้มีคุณภาพ ตามมาตรฐานสถานศึกษาในทุกๆด้าน โดยเฉพาะด้านการพัมนาแหล่งเรียนรู้ และสื่อเทคโนโลยีทางการศึกษา การพัฒนาคุณภาพการเรียนการสอน และการพัฒนาคุณภาพนักเรียนให้เป็นคนเก่ง ดี มีสุข มีความเป็นไทย และสามารถใช้ภาษาต่างประเทศสื่อสารค้นคว้าแลกเปลี่ยนความรู้ในสากลโลกได้ วันที่ 6 พฤศจิกายน 2546 นายสุวรรณ เค้าฝาย ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีนนทบุรี ได้พัฒนาศักยภาพของนักเรียนในทุกด้านทั้งด้านคุณธรรม จริยธรรม ความสามารถด้านวิชาการ ด้านกีฬา ทักษะในการดำรงชีวิตพร้อมทั้งการพัฒนาโรงเรียน เข้าสู่ยุคเทคโนโลยีสารสนเทศเพื่อให้โรงเรียนมีความทันสมัย ก้าวหน้า ทันโลก ทันเหตุกาณ์ ด้วยการพัฒนาการเรียนการสอนคอมพิวเตอร์ และภาษาต่างประเทศควบคู่กับการเรียนการสอนสาระการเรียนรู้อื่นๆ ณ วันนี้ โรงเรียนสตรีนนทบุรี เป็นโรงเรียนมัธยมศึกษาขนาดใหญ่พิเศษ จัดการศึกษาเฉพาะสตรีล้วนทั้งระดับมัธยมศึกษาตอนต้น และมัธยมศึกษาตอนปลายประกอบด้วยอาคารเรียน 4 หลัง อาคารอเนกประสงค์ 1 หลัง อาคารประกอบ 13 หลัง มีนักเรียนทั้งหมด 2,895 คน ครู-อาจารย์ 145 คน ลูกจ้างประจำและนักการภารโรง 18 คน การจัดการศึกษาโรงเรียนตามนโยบายของสำนักงานคณะกรรมการ การศึกษาขั้นพื้นฐาน โดยมีองค์กรการบริหารงาน ดังนี้
โรงเรียนสตรีนนทบุรีมีความมุ่งมั่น ปรับปรุงพัมนาในทุกด้าน ทั้งการจัดบรรยากาศ สิ่งแวดล้อมส่งเสริมด้านวิชาการ ปลูกฝังคุณธรรม จริยธรรม ปรับปรุงพัมนางานฝ่ายต่างๆ ให้มีความพร้อมสมบูรณ์ทั้งบุคคลากร วัสดุอุปกรณ์การศึกษา เพื่อให้โรงเรียนมีมาตรฐานตามนโยบาย สำนักงานคณะกรรมการการศึกาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ และระบบการประกันคุณภาพการศึกษาแห่งชาติ และตามความต้องการของชุมชนในท้องถิ่น ซึ่งโรงเรียนสตรีนนทบุรีได้รับความร่วมมือเป็นอย่างดี จากคณะกรรมการสถานศึกษา สมาคมศิษย์เก่าสตรีนนท์-พลับลา สมาคมผู้ปกครองและครูสตรีนนทบุรี มูลนิธิบุญช่วย-ลัดดาวัลย์ มูลนิธิบำเพ็ญ ภู่โสภา มูลนิธิประกอบ-นิศารัตน์ มูลนิธิคนึง ไทยประสิทธิ์ รวมทั้งบุคลากรทุกฝ่ายในโรงเรียน มีความร่วมมือร่วมใจในการมุ่งพัฒนาลูกสตรีนนทบุรีให้เป็นผู้มีความรู้ มีคุณธรรม และจริยธรรม มีมารยาทตามวัฒนธรรมประเพณีไทย และประสบความสำเร็จในการเรียนและการศึกษาต่อ สมกับที่เป็นโรงเรียนสตรีประจำจังหวัดหนึ่งเดียวในจังหวัดนนทบุรี